I don´t believe that calling somebody "Miss" can be seen as discrimination.

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http://www.bbc.com/news/blogs-magazine-monitor-27407789
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New York City skyline from Empire State

New York City skyline from Empire State







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Visita al herbario NY. Para revisar coleccion de helechos epifitos. Encantado con todo.

Visita al herbario NY. Para revisar coleccion de helechos epifitos. Encantado con todo.


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Hoy mis alumnos han estudiado familia Poaceae.

Hoy mis alumnos han estudiado familia Poaceae.
Entre los hechizos que vimos fueron:
Panicum maximum - este hechizo causa temor y pánico extremos, sobre todo es útil durante un examen;
Bromus gracilis - aplicación de este conjuro produce en victima deseo de bromear y decir cosas graciosas sin parar. Читать дальше......

Statistical Learning completed

I had successfully completed the on-line course Statistical Learning imparted by T. Hastie & R. Tibshirani in Stanford University. Читать дальше......

The Pervert's Guide to Ideology

The Pervert's Guide to Ideology 
film by Slavoj Žižek & Sophie Fiennes

http://www.zeitgeistfilms.com/film.php?directoryname=pervertsguidetoideology&mode=synopsis

http://disculpenlasmolestias.net/2013/11/01/the-perverts-guide-to-ideology/
http://www.zeitgeistfilms.com/film.php?directoryname=pervertsguidetoideology&mode=synopsis Читать дальше......

А. С. Пушкин. 1823.

А. С. Пушкин. 1823.

Свободы сеятель пустынный,
Я вышел рано, до звезды;
Рукою чистой и безвинной
В порабощенные бразды
Бросал живительное семя —
Но потерял я только время,
Благие мысли и труды...

Паситесь, мирные народы!
Вас не разбудит чести клич.
К чему стадам дары свободы?
Их должно резать или стричь.
Наследство их из рода в роды
Ярмо с гремушками да бич Читать дальше......

Hoy fuimos a ver El Príncipe Igor, transmitida de Opera Metropolitana de Nueva York. La interpretación en MET...

Hoy fuimos a ver El Príncipe Igor, transmitida de Opera Metropolitana de Nueva York. La interpretación en MET comienza con la frase "To unleash a war is the surest way to escape from oneself" - algo completamente vigente hoy el día.

Es una ópera espectacular, con la música enormemente bella y compleja de Alexander Borodin, y con una reinterpretación moderna de escenografía, diseñada por Dmitri Tcherniakov. Opera es la interpretación musical de los eventos historicos que han tenido lugar en la historia del estado ruso en el siglo XI y descritas en El cantar del príncipe Igor. Esta obra tiene una vigencia impresionante en el contexto de las actuales problemas políticas en la Europa del Este, particularmente en Ucrania y Rusia - mismos territorios donde se desarrolla la historia original. Las problemas políticas, históricas y éticas mencionadas en la opera parecen persistir en las acciones de los gobernantes de Rusia desde los tiempos de Igor. Parece que no ha cambiado nada en estos 10 siglos. 

(http://www.nybooks.com/articles/archives/2014/mar/20/great-prince-igor/?pagination=false)

(http://www.metoperafamily.org/uploadedFiles/MetOpera/8_live_in_hd/cast%20sheets/Igor.synopsis.US.pdf)
http://www.nybooks.com/articles/archives/2014/mar/20/great-prince-igor/?pagination=false Читать дальше......

El barco legendario visita Puerto Vallarta del 11 a 13 de enero.

El barco legendario visita Puerto Vallarta del 11 a 13 de enero. (http://www.subetealbarco.org/rainbow/?origen=mailCibersRW10012014&hq_e=el&hq_m=2970082&hq_l=3&hq_v=fec20b1bd5) 
¡Lastima que por el trabajo de campo en Chiapas no voy a podes subir a Rainbow Warrior de Greenpeace esta vez!
http://www.subetealbarco.org/rainbow/?origen=mailCibersRW10012014&hq_e=el&hq_m=2970082&hq_l=3&hq_v=fec20b1bd5 Читать дальше......

El que a este mundo Vino y no bebió Vino ¡A que coño Vino!

El que a este mundo Vino y no bebió Vino ¡A que coño Vino!

La comida, bebida y ambiente en La Viña de Bacco (San Cristobal de las Casas) con excelentes y exquisitos.
Tome lo mismo que consumio Matt Gross de NY Times hace 5 años, y con el mismo costo.
Es mi segunda visita a este lugar (bar). Lo considero muy recomendable.

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PhD Traditional Christmass Song ;)

PhD Traditional Christmass Song ;)
http://www.phdcomics.com/comics/archive.php?comicid=1114 Читать дальше......

Christmass frustration:

Christmass frustration:

Unfinshed thesis:
http://www.phdcomics.com/comics/archive.php?comicid=804

Santa unexistence proof:
http://www.phdcomics.com/comics/archive.php?comicid=1668
http://www.phdcomics.com/comics/archive.php?comicid=804 Читать дальше......

The real relation between room clean-up and work to do. :)

The real relation between room clean-up and work to do. :)

http://phdcomics.com/comics/archive.php?comicid=1658
http://phdcomics.com/comics/archive.php?comicid=1658 Читать дальше......

Interesting article:

Interesting article:
Mayer et al. 2013. A mitochondrial genome sequence of a hominin from Sima de los Huesos. Nature doi:10.1038/nature12788

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature12788.html

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/fig_tab/nature12788_SF6.html
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Participación en el concurso de CONABIO para sistema de información de especies de árboles de México

Participación en el concurso de CONABIO para sistema de información de especies de árboles de México
http://blog.rebiomex.org/2013/11/participacion-el-el-concurso-de-conabio.html Читать дальше......

Mi cartel en Congreso Mexicano de Botánica en Chiapas (presento mañana)

Mi cartel en Congreso Mexicano de Botánica en Chiapas (presento mañana)
http://vshalisko.blogspot.com/2013/10/nuestro-cartel-en-el-congreso-mexicano.html Читать дальше......

Nuestro cartel en el Congreso Mexicano de Botánica

Mañana (21 de octubre del 2013) presento nuestro cartel en el XIX Congreso Mexicano de Botánica con sede en Tuxtla Gutiérrez, Chiapas.
Tema: Biogeografía de Grammitidaceae en México y Centroamérica
Autores: Viacheslav Shalisko, J. Antonio Vázquez García, Miguel A. Muñiz Castro y Alma Rosa Villalobos Arámbula
Sesión: CA1. BIOGEOGRAFÍA Y BIOLOGÍA EVOLUTIVA - CARTEL 539

Cartel en PDF

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Q. What is the oddest type specimen collection?

Q. What is the oddest type specimen collection?
A. The grave in Sweden storing Homo sapiens lectotype. Читать дальше......

Mi ponencia en el Seminario de Botánica sobre Codigo de Barras de ADN en los helechos

Mi ponencia en el Seminario de Botánica sobre Codigo de Barras de ADN en los helechos
http://vshalisko.blogspot.com/2013/10/ponencia-en-seminario-de-botanica.html Читать дальше......

Ponencia en Seminario de Botánica Sistemática sobre Código de barras de ADN en los helechos

Hoy en seminario de Botánica Sistemática (XXXVI ciclo de Seminarios) presente la ponencia Codigo de barras de ADN aplicado a los helechos: alcances y limitaciones.

Resumen (en pdf) y ponencia (en pdf).

Resumen

La tecnología de código de barras de ADN se convirtió en una de las herramientas poderosas para realizar estudios en sistemática vegetal, ecología, filogeografía, biogeografía y en numerosos ciencias aplicadas relacionados con la biología de plantas. En el caso de los helechos, el uso de código de barras de ADN es particularmente importante, ya que tiene potencial de facilitar la identificación taxonómica tanto de los esporofitos en estado vegetativo, como de gametófitos - fase críptica en el ciclo de vida de pteridofitas.

Las regiones que se utilizan como código de barras de ADN para plantas terrestres fueron aprobadas en 2009 por el Consorcio para Código de Barras de la Vida (CBOL, Consortium for the Barcode of Life) y corresponden a dos loci de ADN de cloroplastos, rbcL y matK. Estas regiones han demostrado variabilidad apropiada para los propósitos de identificación de los taxa (a tal grado que la variabilidad de los haplotipos de cloroplastos puede estar relacionada con los límites entre las especies) y además se obtienen con relativa facilidad en los principales linajes de espermatofitas.

En los helechos, la región matK presenta problemas para secuenciarla por pérdida de los dos exones vecinos de trnK, lo que causa dificultades en su amplificación con los cebadores universales. Fue hasta el año 2011, cuando el desarrollo de los cebadores específicos para la región matK para los helechos permitió su uso exitoso en combinación con rbcL como parte del código de barras de ADN estándar. Adicional a la combinación rbcL-matK, para código de barras para los helechos se ha propuesto el uso de otras regiones de genoma, entre ellas trnL-F, atpB, rps4 y trnH-psbA, estas últimas de utilidad limitada debido a su baja variabilidad en este grupo.

El avance rápido de la tecnología "secuenciación de siguiente generación" (NGS, Next Generation Secuencing) resulta en una disminución sustancial del costo de secuenciación y permite realizar los proyectos individuales de los investigadores que requieren de secuenciación a mediana escala. Una de las aplicaciones prometedoras de la tecnología NGS es la obtención del código de barras, incluyendo las lecturas rutinarias del genoma completo de cloroplastos, que se propuesta como alternativa al código de barras basado en loci.

Bibliografía

Arjen de Groot, G. et al. 2011. Use of rbcL and trnL-F as a two-locus DNA barcode for identification of NW-European ferns: an ecological perspective. PLoS One 6(1): e16371. doi:10.1371/journal.pone.0016371
Hollingsworth, P. M. et al. 2011. Choosing and using a plant DNA barcode. PLoS One 6(5): e19254. doi:10.1371/journal.pone.0019254.
Kuo, L.-Y. et al. 2011. First insights into fern matK phylogeny. Molecular Phylogenetics and Evolution 59: 556-566.
Li, F.-W. et al. 2011. rbcL and matK earn two thumbs up as the core DNA barcode for ferns. PLoS One 6(10): e26597. doi:10.1371/journal.pone.0026597.
Pryer, K. M. et al. 2010. DNA barcoding exposes a case of mistaken identity in the fern horticultural trade. Molecular Ecology Resources 10: 979-985. doi: 10.1111/j.1755-0998.2010.02858.x
Sucher, N. J., J. R. Hennell & M. C. Carles (eds.) 2012. Plant DNA fingerprinting and barcoding: Methods and protocols. Methods in Molecular Biology, vol. 862. Springer Science+Business Media, LLC. 202 p. doi:10.1007/978-1-61779-609-8.
Wolf, P. G. et al. 2011. The evolution of chloroplast genes and genomes in ferns. Plant Molecular Biology 76: 251-261. doi:10.1007/s11103-010-9706-4.

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