May 8, 2013

Ponencia en Seminario de Botánica sobre Evolución tectonica de Centroamérica

Hoy presente mi ponencia en este ciclo de seminarios de Botánica Sistemática (XXXV ciclo de Seminarios). Tema de ponencia: Evolución tectónica de Centroamérica y sus implicaciones para la biogeografía.

Ponencia en PDF


Resumen:

La teoría de la tectónica de placas, que se desarrollo a partir de la hipótesis propuesta en 1915 por Alfred Wegener, representa uno de los paradigmas centrales de las Ciencias de la Tierra. Los estudios de la tectónica de placas, realizados en la última década, resultaron en una importante actualización de las reconstrucciones paleogeográficas de la región de México y Centroamérica. Así, Keppie (2004), Weber et al. (2010) rastrean la historia del microcontinente Oaxaquia y de las estructuras relacionadas desde su surgimiento 1.2 Ga en el margen de la Amazonia. Rogers et al. (2007) y Morán-Zenteno et al. (2009) analizan la evolución del bloque Neoproterozoico Chortis, que corresponde al terreno de las actuales Nicaragua y Honduras. La reconstrucción de Pindell et al. (2005), Pindell y Kennan (2009) abarca los últimos 200 Ma de la evolución tectónica regional del Caribe, Golfo de México, Centroamérica y Norte de Sudamérica. Ferrari et al. (2012) analizan la secuencia de eventos volcánicos en la Faja Volcánica Transmexicana desde el Mioceno Temprano.



La inferencia de eventos paleogeográficos en la evolución de la diversidad florística en los Neotrópicos puede ser muy alta, como esta propuesto, por ejemplo, en el análisis de Gentry (1982). La reconstrucción actualizada de la secuencia de eventos paleogeográficos y paleoclimáticos en los Neotrópicos forma la base para una nueva síntesis biogeográfica, los elementos de esa síntesis en la aplicación a la evolución de la flora están trazados en Hughes et al. (2013).

Bibliografía selecta:

Ferrari, L. et al. 2012. The dynamic history of Trans-Mexican Volcanic Belt and the Mexico Subduction Zone. Tectonophysics 522-523: 122-149.
Gentry, A. H. 1982. Neotropical floristic diversity: Phytogeographical connections between Central and South America, Pleistocene climate fluctuations, or an accident of Andean orogeny? Annals of the Missouri Botanical Garden 69(3): 557-593.
Hughes, C. J. et al. 2013. Neotropical Plant Evolution: Assembling the Big Picture. Botanical Journal of the Linnean Society 171: 1–18.
Keppie, D. 2004. Terranes of Mexico Revisited: A 1.3 Billion Year Odyssey. International Geology Review 46: 765–794.
Morán-Zenteno, D. J. et al. 2009. Reassessment of the Paleogene position of the Chortis block relative to southern Mexico: hierarchical ranking of data and features. Revista Mexicana de Ciencias Geológicas  2(1): 177-188.
Pindell, J. L. et al. 2005. Plate-kinematics and crustal dynamics of circum-Caribbean arc-continent interactions: Tectonic controls on basin development in Proto-Caribbean margins. The Geological Society of America Special Paper  394: 7-52.
Pindell, J. L. y L. Kennan. 2009. Tectonic evolution of the Gulf of Mexico, Caribbean and northern South America in the mantle reference frame: an update. Geological Society, London, Special Publications 328: 1-55.
Rogers, R. D. et al. 2007. Tectonic terranes of the Chortis block based on integration of regional aeromagnetic and geologic data. The Geological Society of America Special Paper 428: 65-88.
Weber, B et al. 2010. U–Pb and Lu–Hf isotope systematics of lower crust from central-southern Mexico – Geodynamic significance of Oaxaquia in a Rodinia Realm. Precambrian Research 182: 149–162.

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Apr 28, 2013

Bayesian phylogenetic analysis of Grammitidaceae

Materials for reconstruction of Grammitidaceae phylogeny (part of my current research). 
First attempt with cpDNA (rbcL, atpB, trnL-F) for 217 samples from GenBank using Bayesian inference. 
Tools: MrBayes 3.2.1 x64 + BEAGLE, jModelTest 2.1.3, Geneious 6.0.6 Trial, FigTree 1.4.0, Tracer 1.5, (+ BEAST for molecular clock tests, not included to this post).
Options: models selected with Akaike information criteria (atpB = TVM+I, rbcL = TrN+I, trnL-F = K80+I); 15·10⁶  generations in Markov chain Monte Carlo sampling, 10% burn-in, 27000 resulting trees, tree selection criteria Posterior Probability > 0.5.
Resulting tree looks like nice, but there are some basal polytomy and many of basal nodes are weakly supported. Reconstruction for New World genera looks compartible with published papers, but topology for genera from Tropical Asia seems to be an atrifact of poor sampling (according to M.Sun. comments). Not so bad for first attempt, after all.
Some pictures below.

Consensus tree.


Unrooted graph and some Tracer output





Allignment in Genious 6, using Muscle algorithm and manual ajustment.

P.S. Another consensus tree, afeter some severe problems in trnL-F allingment were resolved.


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Apr 9, 2013

Title


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Mar 17, 2013

Paleobathymetry data preparation How-To

You can download Dietmar Muller & Maria Seton (2008) data on paleobathymetry and oceanic crust age during last 140 Ma at http://www.earthbyte.org/Resources/palaeoagegrid2008.html

1. Extract contents of age_depth_bath_0.bz2 with any suitable archivier (like 7-zip).

2. Using Open Source tool set GMT (General Mapping Tools, http://gmt.soest.hawaii.edu/) ver. 4.5.9 64-bits (Windows 8) to process data.
Set table data delimiter:
gmtset.exe FIELD_DELIMITER=,

Extract three columns of data from table to make XYZ format ASCII file:
gmtconvert.exe age_depth_bath_0.xyadb -F0,1,2 -V > age_0.csv
Fore some reason, xyz2grd produce inverse projected grid (south-north is switched), so it is necessary to make nagative values of latitude in table:
gmtmath.exe -C1 -V age_0.csv NEG = age_0i.csv
Convert to netCDF grid of floating point values:
xyz2grd.exe age_0i.csv -Gage_0.flt=nf -N0 -Rd -I0.1 -V

Add header to this grid:
File age_0.hdr
ncols 3601
nrows 1801
xllcorner -198
yllcorner -90
cellsize 0.1
nodata_value 0
NODATA 0


3. Open in GIS application, set projection (geographic with datum WGS-1984), save in suitable format (GeoTiff), calculate statistics and pyramid layers.

For bathymetry data estract firth column instead of third from original table.
gmtconvert.exe age_depth_bath_0.xyadb -F0,1,2 -V > age_0.csv
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Mar 11, 2013

Ponencia sobre Cambio Climático en cine-foro estudiantil, CUCBA, Universidad de Guadalajara.

pinencia en PDF




Bibliografia selecta:


  • Adams. 2008. Vegetation-climate interactions. How plants make the global environment. 2nd ed. Springer. Praxis Publishing. 266 pp.
  • Cox & Jones. 2008.  Illuminating the modern dance of climate and CO2. Science 321: 1642-1644.
  • Friedman (ed.) 2009. Climate change .  Writing the critical essay, an opposing viewpoints guide. Gale. Cengage Learning.  128 pp.
  • Gornitz (ed.) 2009. Encyclopedia of paleoclimatology & ancient environments. Springer Science, Business Media B. V. 1048 pp.
  • Hansen et al. 2008. Target atmospheric CO2: where should humanity aim? The Open Atmospheric Science Journal 2: 217-231.
  • Huntingford et al. 2013. Simulated resilience of tropical rainforest to CO2-induced climate change. Nature Geoscience doi:10.1038/ngeo1741
  • IPCC. 2007. Climate Change 2007. The Physical Science Basis. Contribution of Working Group I to the Fourth Assessment Report of the Intergovernmental Panel on Climate Change. Solomon, S., D. Qin, M. Manning, Z. Chen, M. Marquis, K.B. Averyt, M. Tignor and H.L. Miller (eds.). Cambridge University Press.  996 pp.
  • Kiehl. 2011. Lessons from Earth´s past. Science 331: 158-159.
  • Marcott et al. 2013. A reconstruction of regional and global temperature for the past  11,300 years. Science 339: 1198-1201.
  • Melles et al. 2012. 2.8 millions years of Arctic climate change from lake El’Gygytgyn, NE Russia. Science 337: 315-320.
  • Severinghaus et al. 2009. Oxygen-18 of O2 records the impact of abrupt climate change on the terrestral biosphere. Science 324: 1431-1434.
  • Steffenson et al. 2008. High-resolution Greenland ice core data show abrupt climate change happens in few years. Science 321: 680-683.


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Feb 27, 2013

О физическом вакyуме и стабильности Вселенной. Забавное обсуждение в комментариях.

О физическом вакyуме и стабильности Вселенной. Забавное обсуждение в комментариях.

http://elementy.ru/LHC/news?discuss=431980

Degrassi et al. 2012. Higgs mass and vacuum stability in the Standard Model at NNLO. arXiv:1205.6497v1.
Abstract: http://arxiv.org/abs/arXiv:1205.6497
Полный текст (http://arxiv.org/pdf/1205.6497v1.pdf) на любителя.
http://elementy.ru/news/431980?page_design=print Читать дальше......

Sep 12, 2012

Ponencia en Seminario de Botánica sobre sistemática de helechos

Hoy presente una ponencia en XXXIV Ciclo de Seminarios de Botánica Sistemática del Instituto de Botánica de la Universidad de Guadalajara. El tema de mi ponencia fue "Nueva Propuesta de clasificación para los helechos leptosporangiados del clado Eupolypods II y su radiación en el Cenozoico". Presentación se basó en revisión de recientes articulos de Rothwels et al. (2012 a, b), con referencias a clasificación de Smith et al. (2006).



Resumen:
Las relaciones filogenéticas de los helechos y las plantas afines fueron profundamente revisadas durante la última década, utilizando los datos moleculares y morfológicos (e. g. Smith et al. 2006, Schneider et al. 2009). La nueva hipótesis sobre las relaciones filogenéticas fue base para clasificación, propuesta en Smith et al. (2006). Sin embargo, la evolución en el orden Polypodiales, el más diverso de los helechos con ~7230 especies no fue reconstruida con una resolución satisfactoria. El reciente trabajo del grupo de Rothfels (2012a, 2012b) está enfocado a uno de los principales linajes en Polypodiales, conocido como Eupolypods II. La nueva hipótesis filogenética, propuesta por estos autores para este grupo, implica modificaciones en clasificación a nivel de familias.
Durante la reconstrucción de las relaciones entre los miembros de Eupolypods II, los investigadores han resuelto una compleja situación filogenética, relacionada con la rápida divergencia entre los linajes en los inicios del Cenozoico. La rápida diversificación de los miembros de Polypodiales durante el Cenozoico, es determinante para la actual diversidad de los helechos leptosporangiados (Shcuettpelz y Pryer 2009). Esta diversificación puede estar relacionada con el surgimiento de nuevos nichos ecológicos en los bosques dominados por angiospermas. Sin embargo, en la historia evolutiva de los helechos leptosporangiados, que inició hace 350 Ma en el Carbonifero, se reconocen por lo mínimo tres episodios de diversificación y radiación que han sucedido sucesivamente, combinados con las extinciones posteriores. Solo la última radiación puede estar vinculada con la ocupación de los nichos en ecosistemas dominados por angiospermas.

Bibliografía:
• Rothfels et al. 2012a. A revised family-level classification for Eupolypod II ferns (Polypodiidae: Polypodiales). Taxon 61(3): 515-533.
• Rothfels et al. 2012b. Overcoming deep roots, fast rates, and short internodes to resolve the ancient rapid radiation of Eupolypod II ferns. Syst. Biol. 61(3): 490-509.
• Schneider et al. 2009. Is morphology really at odds with molecules in estimating fern phylogeny? Syst. Bot. 34(4): 455-475.
• Shcuettpelz y Pryer 2009. Evidence for a Cenozoic radiation of ferns in an angiospermdominated canopy. PNAS 106(27): 11200-11205.
• Smith et al. 2006. A classification for extant ferns. Taxon 55(3): 705-731.


Resumen en PDF   Ponencia en PDF Читать дальше......

Sep 9, 2012

Historia de teoría de simbiogénesis: Margulis vs. Mereschkovsky y Kozo-Polyansky

La teoría de endosimbiosis hoy el día está plenamente reconocida como parte de paradigma de evolución de las eucariotas. Esta teoría frecuentemente se atribuye a evolucionista estadounidense Lynn Margulis (1938-2011), quien desarrollo su hipótesis sobre evolución de células eucarióticas en los finales de 1960-s. Esta teoría la hizo muy famosa. Pero en principio no fue fácil para ella lograr que comunidad científica aceptaba su propuesta; antes de ser publicada en 1967, el articulo original fue rechazado en 15 revistas científicas respetables.

Lynn Margulis (1938-2011)
Konstantin Mereschkovsky (1855-1921)



 Para Lynn Margulis en 1967 paso inadvertido el hecho, de que su propuesta no fue completamente nueva para la ciencia. Al revisar con mayor detalle historia de este descubrimiento, no se puede omitir contribución de varios científicos de los finales del siglo XIX - inicios del siglo XX. Hoy el dia está claro que prioridad de este descubrimiento no pertenece a Lynn Margulis.

Boris Kozo-Polyansky (1890-1957)


En particular la hipótesis sobre endosimbiósis de cloroplastos fue inicialmente publicada por científico ruso Konstantin Mereschkovsky (Константин Сергеевич Мережковский) en el año 1905. El botánico ruso Boris Kozo-Polyansky (Борис Михайлович Козо-Полянский) seguio desarrollando las ideas de enbosimbiósis y simbiogénesis como un principio fundamental de la evolución, publicando en 1924 el libro: "Symbiogenesis: A New Principle of Evolution".
(La reciente traducción de este libro a ingles, editado por Victor Fet y Lynn Margulis, fue publicado en 2010 libro en amazon.com libro en Google Books ).

Esquema de las etapas de simbiogénesis, dibujo de Kathryn Delisle citado en varios trabajos de L. Margulis.


 Misma Lynn Margulis posteriormente reconocía prioridad de K. Mereschkovsky y B. Kozo-Polyansky sobre concepto de endosimbiósis y su papel en la evolución. Margulis supo por primera vez sobre existencia de los autores rusos que la han adelantado con la teoría de simbiogénesis solo en 1975, cuando ella fue invitada a una conferencia en Leningrado (URSS, actualmente San Petersburgo), organizado por conocido botánico Armen Takhtajan.

 Fragmento de reseña de la publicación del libro de Kozo-Polyansky en 2010 Manjaarez, A. 2010. Symbiogenesis: A New Principle of Evolution Dusting Off an Ancient B. Lab Times 5: 70:

Some years later, in 1975, she and Peter Raven, a botanist and also a supporter of this theory, were invited to a panel session in Leningrad about the origins of chloroplasts, organised by the Armenian-Russian botanist Armen Takhtajan. It was then, Margulis and Raven plausibly assert, that they heard about Boris Mikhaylovich Kozo-Polyansky for the first time. 

 Fragmento de la entrevista de Lynn Margulis a Discover Magazine:

Dick Teresi: In contrast, the symbiotic view of evolution has a long lineage in Russia, right?

Lynn Margulis: From the very beginning the Russians said natural selection was a process of elimination and could not produce all the diversity we see. They understood that symbiogenesis was a major source of innovation, and they rejected Darwin. If the English-speaking world owns natural selection, the Russians own symbiogenesis. In 1924, this man Boris Mikhaylovich Kozo-Polyansky wrote a book called Symbiogenesis: A New Principle of Evolution, in which he reconciled Darwin’s natural selection as the eliminator and symbiogenesis as the innovator. Kozo-Polyansky looked at cilia—the wavy hairs that some microbes use to move—and said it is not beyond the realm of possibility that cilia, the tails of sperm cells, came from “flagellated cytodes,” by which he clearly meant swimming bacteria.

Fragmento del capitulo 7 de libro de Lynn Margulis "Una Revolución en la Evolución", autor del capitulo Antonio Lazcano Araujo, libro publicado en español por Universidad de Valencia, 2003.


Estas ideas, aunque marginales, habrían de tener rаmifiсаciones lejanas. А principios del siglo ХХ, у аun antes de que existiera un esquema minimamente coherente sobre lа evolución de los procariontes, los rusos Konstantin S. Merezhkovsky, Andrei S. Famintsyn у Boris М. Kozo-Polyanski [...] propusieron еn fоrmа independiente escenarios evolutivos que pretendian explicar еl origen de las celulas animales у vegetales afirmando que mitocondrias, cloroplastos у algunas otras estructuras de los eucariontes еrап resultado de procesos de simbiosis (Khakhina 1979). Aunque durante muchos anos permanecieron desconocidos роr el mundo academico occidental, llevada роr su extraordinaria honestidad intelectual Lynn Margulis ha promovido у divulgado tanto las aportaciones de Merezhkovsky, Famintsyn у Kozo-Polyanski, соmо los trabajos del estadounidense Ivan Е. Wallin, a los que rесоnосе у reinvidica соmо sus predecesores cientificos (véase, роr ejemplo, Margulis 1991а о еl capitulo 6).

Es verdad que Margulis conocia, de mаnеrа indirecta, аlgunas de las hipótesis de Merezhkovsky у Wallin (Sagan 1967) у que hubo otras propuestas sobre еl origen de los еucariontes mas о menos simultaneas а su teoria (Goksoyr 1967). Sin embargo, es igualmente cierto que las propuestas de Merezhkovsky, Famintsyn у Kozo-Polyanski осираbаn un lugar marginal еn lа biologia rusa (Sapp 1995), у que se tratabаеn buеnа medida, de especulaciones basadas еn muу pocas
observaciones empiricas. Merezhkovsky, роr ejemplo, nиnса habló еn fоrmа explicita del origen de las mitocondrias, cuyas funciones ignoraba, у еn un folleto publicado en 1909, afirmó que los seres vivos estaban formados роr dos plasmas celulares de origen independiente, i.e., еl micoplasmа, que habia dado origen а hongos, bacterias у organulos celulares, у el amiboplasma, perfectamente visible en las аmеbas, de donde habrian surgido plantas у animales (Khakhina 1979). А pesar de las ambiguedades de un esquema esencialmente especulativo, раrа Merezhkovsky еl amiboplasma соnstituia еl precursor evolutivo de lo que hoy llamamos nuсlеоcitoplasma [...]


En 2010 Margulis publico un articulo sobre contribución de los científicos rusos en desarrollo de la teoría de simbiogénesis, donde se menciona que trabajos de estos autores rusos quedaron fuera de alcance de muchos de los científicos anglófonos.
Margulis, L. 2010. Symbiogenesis. A New Principle of Evolution Rediscovery of Boris Mikhaylovich Kozo- Polyansky (1890–1957). Paleontological Journal 44(12): 1525–1539. Mismo articulo esta incluido en paginas 34-45 de los materiales de conferencia Charles Darwin and Modern Biology. Proceedings of the International Academic Conference 21–23 September, 2009. Saint-Petersburg.

 Mas sobre la tema:
 Nota sobre vida de Lynn Margulis:
Knoll, A. H. 2012. Lynn Margulis, 1938–2011. PNAS 109(4): 1022.

Articulo de Lynn Margulis sobre simbiogénesis y estatus actual de su teoría:
Margulis, L. 2004. Serial endosymbiotic theory (SET) and composite individuality Transition from bacterial to eukaryotic genomes. Mirobiology Today 31: 172-174.


Articulo sobre Konstantin Mereschkovsky y sus ideas:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15045832 Sapp, J., F. Carrapiço, M. Zolotonosov. 2002. Symbiogenesis: The Hidden Face of Constantin Merezhkowsky. Hist. Phil. Life Sci. 24: 413-440. Читать дальше......

Sep 2, 2012

Sobre descubrimiento y venta de Alaska

1) La primera expedición (1725-1730) de los capitanes Vitus Bering e Ivan Fedorov, el arribo de los rusos a las costas de Alaska, descubrimiento del estrecho de Bering.
2) La segunda expedición (1732-1741) de los capitanes Vitus Bering y Aleksey Chírikov, descubrimiento de islas Aleutianas y desembarcamiento en las costas de Alaska.
3) Establecimiento del primer poblado ruso en America, en la isla Kodiak (una de las islas Aleutianas) por Grigori Shelixov en 1784.
4) En 1867 venta de Alaska y de las islas Aleutianas a Estados Unidos de America, por 7.2 millones de dollares.

russiaparachilenos.blogspot.mx/2012/05/la-venta-de-alaska.html

Nota: El bolg Rusia para Hispanoparlantes (http://russiaparachilenos.blogspot.mx) es interesante, aunque algunas publicaciones inclyuyen opiniones demasiado sesgados, desde mi punto de vista. El relato sobre Alaska es bastante completo, pero no libre de algunos inmpreciciones.

Materiales adicionales: http://en.wikipedia.org/wiki/Vitus_Bering

Publicación cross-publicada en Google+.

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Apr 2, 2011

Software for Google imagery workflow (DigitalGlobe visualization to GeoTIFF file).

Step 1. Generate set of landmarks in KML format for Google Earth application with PlaceMaker 2 application (by zed), according to guide.
Step 2. Open landmarks in Google Earth 5.2 (or Google Earth 6), select landmark layer and "play trip" to download all desired area to application cache.
Step 3. Extract information from Google Earth cache with CacheMaster 2, saving in SAS format.
Step 4. Use SAS.Планета 110216 application to visualize area in base of cache content and to merge image fragments (tiles) for selected area into entire image, save image in BMP format, and georefferencing information in any text format. Use information from SAS GIS site.
Step 5. Use gdal_translate application from FWTools 2.46 to assign georeferencing and convert image to GeoTIFF format.

Reference information on Хитрости Google Earth site.

P. S. SAS.Планета and some other applications requires russified windows to represent GUI in the correct form, even if you select English as interface language. To deal with it I installed virtual machine (Microsoft Virtual PC) with Russian version of Windows XP. Читать дальше......

Mar 23, 2011

Cohen Kappa for classification accuracy control

Useful Cohen Kappa statistics tools:

Philippe Bonnardel program (Kappa.exe) - detailed kappa statistics for data up to 25 classes
Pedro Femia Marzo & Antonio Martín Andres tool (Delta 3.2) - delta and kappa measures of agreement between categorical data Читать дальше......

GeoTagging of gigital photos how-to

Tools for GeoTagging of digital photography.

Hardware: GPS Garmin Summit HC + Digital camera Canon EOS Rebel XS + PC
Software:
1. Canon EOS Utility 2.8.1
2. DNR Garmin 5.4.1
3. GPSCorrelate 1.5.6 (win)
4. ExifTool 8.52 (win) + ExifTool-GUI 4.08 (win, optional)
5. MS Excel 2007
6. ArcGIS Decktop 9.3 or any compatible GIS application

While taking photos, digital camera clock should be verified with GPS time, don'to forget tunrn on GPS and to record track.
Step 1. Download photos from camara with EOS Utility (in JPEG)
Step 2. Download GPS track with DNR Garmin (save in GPX format, also it is useful to save it in vector SHP format to have track visualization)
Step 3. Use GPSCorrelate to set individual EXIF geographical metadata in JPEG pictures (whole directory) in base of GPS track (check that Time Zone setting is correct)
Step 4 (optional). Extract geographical metadata just stored in JPEG pictures to list in text file, using ExifTool. In command line it looks like: exiftool.exe -T -r -filename -GPSLatitudeRef -GPSLatitude -GPSLongitudeRef -GPSLongitude -GPSAltitude -DateTimeOriginal e:\Photoes_temp\ > coord_list.txt
Step 5 (optional). Import text file as tab separated table to Excel, use formulas similar to next ones: [=LEFT(C2,FIND(" deg ",C2,1)-1)], [=MID(C2,FIND(" deg ",C2,1)+5,(FIND("' ",C2,1)-FIND(" deg ",C2,1)-5))], [=MID(C2,FIND("' ",C2,1)+1,(FIND(" N",C2,1)-FIND("' ",C2,1)-2))], [=I2+J2/60+K2/3600] to transform strings with coordinates to degrees with fractions.
Step 6 (optional). Import Excel file to ArcGIS, visualize table data using "Display XY data" context menu option (don't forget to select correct coordinate system, like GCS_WGS_1984, or another one depending on GPS data), save visualized layer through "Data->Export data" like point shapefile (SHP). Читать дальше......

Feb 21, 2011

Университетская атмосфера

Жизненное видео про униврситетскую атмосферу.
Bad Project video - Zheng Lab.

Запись итальянского блоггера и учёного-химика из Кембриджа Goodbye academia, I get a life. Он пишет о проблематике построения научной карьеры сегодня и об атмосфере в научном сообществе. Трудно не согласиться с большей частью его наблюдений. Но и сдаваться, как он, тоже бессмысленно. По-русски здесь.

The disposable academic. Why doing a PhD is often a waste of time. (Article in The Economist, Dec 16th 2010).

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Jan 18, 2011

Россия - непревзойденный пример того насколько различными могут быть представления просвещенной элиты и остального населения (масс). Это очевидно сейчас, но, вероятно, было не так очевидно в конце 80-х - начале 90-х. Тогда в воздухе витал фантастический идеализм, казалось что всё возможно. Казалось ещё что мы все вместе и за одно, ну, или, почти все. Подобная иллюзия кажется следствием "советского", следствием идеологии "свободы, равентсва, братства". Отсюда и либерализация, имевшая место в момент конца советской империи. Массы тогда были заражены идеологией свободы, которая, в сущности, была преобразованной советской идеологией. Но потом идеология была забыта. Оказалось что для людей забота о насущном и меркантильном важнее идеалов. Новая экономика способствовала забвению идеалов, так как каждый вынужден был выживать сам. Пока просвещённая элита грезила обществом свободы, для масс на первом месте были экономический кризис и несправедливость повсеместного грабежа. Отмена либерального развития была, к сожалению, неизбежной таких экономических условиях, несмотря на вялое противодействие интеллектуалов. Некоторое время либерализация продолжалась за счёт инерции истории. Но вскоре нашлись лидеры разобравшиеся в том что массы жаждут "хлеба и зрелищ", а не свободы. Либерализм был нужен элите, но оказался ни к чему массам. А уж, тем более, свобода масс не нужна власти. Узурпация власти и ущемление прав подаются как благоприятные для масс явления, часть "стабилизациии" и "порядка" в интересах большинства. В то же время ясно, что интересы власти узко корпоративные. Либеральное развитие осталось в прошлом, шанс упущен. Просвещённая элита, тем временем, сильно поредела.

Правильно, в целом, написано о взаимосвязи свободы и масс. http://lj.rossia.org/users/tiphareth/1442922.html?nc=81 Читать дальше......

Dec 23, 2010

Идея клуба чтения

Размышляю, не организовать ли клуб чтения русской литературы? Это могло бы стать своего рода реаламой моих уроков русского языка как иностранного в Гвадалахаре, продолжающихся в рамках новой Академии русского языка. Мои частные уроки переменовались с недавних пор в академию, хотя на самом деле изменений пока никаких, только смена названия. Конкуренция в преподавании русского в Гвадалахаре обострилась, в настоящее время существуют несколько официальных курсов и ещё больше частных преподавателей. По этой причине я решил зарегистрировать домен www.rusoguadalajara.com и разместить там сайт новой Академии. Может быть, это позволит получить преимущество в конкуренции с другими людьми. А может быть, даже удастся сотрудничать с конкурентами.

Нужно отметить, что уроки русского никогда нельзя было назвать моей основной деятельностью, за семь лет практики, у меня было несколько десятков учеников, но никогда больше пяти одновременно. То есть, прожить на это никогда было нельзя. И иллюзий что будет когда-то можно у меня нет. Однако, наличие учеников позволяет поддерживать контекст, переключаться между видами деятельности и приносит некоторые пополнения в бюджет. И я намерен продолжать заниматься этим пока хватает времени.

Я считаю что у преподавания русского в Гвадалахаре есть потенциал. Затухает явление неприятия всего русского, весьма характерное в Мексике во время постсоветской эпохи. У меня есть ощущение некоторого возобновления интереса. Кроме того, в свете упрощения визового режима для русских может появиться заинтересованность в изучении языка для туристического бизнеса.

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Oct 18, 2010

Роботесса HRP-4C

Это мой любимый андроид. Она очень хороша. Постчеловеческое.

habrahabr.ru/blogs/robot/106328/
habrahabr.ru/blogs/robot/106190/
pinktentacle.com/2010/10/dance-of-the-hrp-4c-cybernetic-human/

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Sep 11, 2010

Lawrence Lessing on “war on drugs” and American mediatic hypocrisy

Reading Free Culture by Lawrence Lessing (www.free-culture.cc/freecontent/) published in 2004. I like this book much. Book is distributed wit Creative Commons license, so it is possible to cite fragments from it.

I'm really share many of this book ideas, particullary one I want to cite here. This is very important idea, specially in current critical for Mexico moment, when "war on drugs" here have left about 28000 victims, and there is no end of this.

Fragment from Free Culture by Lawrence Lessing Free Culture by Lawrence LessingChapter 10: "Property"
Market: Concentration

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In addition to the copyright wars, we’re in the middle of the drug wars. Government policy is strongly directed against the drug cartels; criminal and civil courts are filled with the consequences of this battle. Let me hereby disqualify myself from any possible appointment to any position in government by saying I believe this war is a profound mistake. I am not pro drugs. Indeed, I come from a family once wrecked by drugs—though the drugs that wrecked my family were all quite legal. I believe this war is a profound mistake because the collateral damage from it is so great as to make waging the war insane. When you add together the burdens on the criminal justice system, the desperation of generations of kids whose only real economic opportunities are as drug warriors, the queering of constitutional protections because of the constant surveillance this war requires, and, most profoundly, the total destruction of the legal systems of many South American nations because of the power of the local drug cartels, I find it impossible to believe that the marginal benefit in reduced drug consumption by Americans could possibly outweigh these costs.
[...]
Beginning in 1998, the Office of National Drug Control Policy launched a media campaign as part of the “war on drugs.” [...] But let’s say you think it is a wrong message, and you’d like to run a countercommercial. Say you want to run a series of ads that try to demonstrate the extraordinary collateral harm that comes from the drug war. Can you do it?
Well, obviously, these ads cost lots of money. Assume you raise the money. Assume a group of concerned citizens donates all the money in the world to help you get your message out. Can you be sure your message will be heard then?
No. You cannot. Television stations have a general policy of avoiding “controversial” ads. Ads sponsored by the government are deemed uncontroversial; ads disagreeing with the government are controversial. This selectivity might be thought inconsistent with the First Amendment, but the Supreme Court has held that stations have the right to choose what they run. Thus, the major channels of commercial media will refuse one side of a crucial debate the opportunity to present its case. And the courts will defend the rights of the stations to be this biased.
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Aug 26, 2010

Weak copyright law is good for human progress: case of Germany

Review in Der Spiegel by Frank Thadeusz: No Copyright Law. The Real Reason for Germany's Industrial Expansion? based on Eckhard Höffner study of this subject. (Russian translation: Отсутствие копирайта способствовало технологической революции в Германии 19 века).

Matthew Lasar article in ArsTechnica Did weak copyright laws help Germany outpace the British Empire?

P. S. (28.08.2010): Копирайт и патенты в существуюшем виде - зло, они должны быть упразднены. Разрушены как Карфаген. С нетерпением жду резултатов этих двух процессов: Соучредитель Microsoft судит гигантов Кремниевой долины; Действия Oracle — это нейтронная бомба в лагерь Open Source. Попкорном запасся.

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Aug 16, 2010

Potentiality of carbon capture in San Andres forest communities is the longest projects I ever participated. Five years after it's beginnig, still I should develop something related to it, though generally this project was not a successful one. Читать дальше......