Nov 2, 2014

Ponencia en el seminario de botánica

Mi ponencia en el seminario de botánica 2014B:
Evolución de la morfogénesis de las hojas en las plantas: papel de redes regulatorias.

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Resumen

Morfogénesis de hojas fue objeto de estudios en la biología de las plantas desde la primera mitad del siglo 20. Fueron propuestas varios mecanismos de control morfogénico, no exclusivas mutuamente, que incluyen mecanismos de termorregulación, biomecánicos, patrones hidráulicos, de fitohormonas y de expresión de genes, entre otros. En la última década los avances en los métodos de biología molecular, experimentos con organismos transgénicos y uso de coloración diferencial histológica de expresión de genes (GUS reporter system) han revolucionado esta área, permitiendo entender a detalle las bases genéticas de la morfogénesis. Fue revelado, que en gran parte la evolución de la forma de las hojas es el resultado de la evolución en las familias de genes regulatorios claves, entre ellos KNOX, ARP, CUC, PIN1, LFY/UNI, WOX. En las plantas con flor la expresión diferencial de estos genes resulta en la definición de los patrones de división, diferenciación y crecimiento celular en las hojas, que se transforma en el patrón morfogénico.

Recientemente Vlad et al. (2014) han estudiado el papel regulatoria del gen RCO en plantas de la familia Brassicaceae, donde este gen participa en el control de la forma de las hojas, determinándolos como simples o compuestas. Los autores han trazado el origen de este gen en consecuencia de de una duplicación y posterior diversificación regulatoria.

La evolución de los genes reguladores parece ser un mecanismo principal para el surgimiento de nuevos patrones morfogénicos y, en consecuencia, nuevos caracteres morfológicos. Es importante que en la evolución de los genes reguladores de la morfogénesis participa no solo la estructura de la parte codificante de proteínas, pero son aun mas importantes los cambios en algunos regiones no codificantes, que participan en el control de la expresión de estos genes. El análisis de los mecanismos genéticos de morfogénesis permiten establecer una relación directa entre los caracteres morfológicos y moleculares (de ADN), algo que parece ser importante en diseño de los matrices de datos combinados en sistemática filogenética.

Literatura

Vlad, D. et al. 2014. Leaf shape evolution through duplication, regulatory diversification, and loss of a homeobox gene. Science 343: 780–783.
Nicotra, A. B. et al. 2011. The evolution and functional significance of leaf shape in the angiosperms. Functional Plant Biology 38: 535-552.
Smith, R.S. et al. 2006. A plausible model of phyllotaxis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103: 1301-1306.
Tomescu, A. M. F. 2008. Megaphylls, microphylls and the evolution of leaf development. Trends in Plant Science 14(1): 5-12.
Williams, M.E. 2012. Evolutionary and developmental origin of leaves. Teaching tools in plant biology: Lecture notes. The Plant Cell (online) doi/10.1105/tpc.109.tt1109.
Chandler, J. y Williams, M.E. 2013. Genetic control of leaf development. Teaching tools in plant biology: Lecture notes. The Plant Cell (online) doi/10.1105/tpc.109.tt1209.

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Sep 14, 2014

Ponencia en el foro sobre Abies

Ponencia en el foro sobre Abies
Publico mi ponencia Morfométria y rasgos estructurales de las especies de oyamel en el Occidente de México que presente el pasado 12 de septiembre en el Foro para el conocimiento y conservación de los Oyametales del Occidente de México en el Palacio Munici...
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Ponencia en el foro sobre Abies

La ponencia Morfométria y rasgos estructurales de las especies de oyamel en el Occidente de México fue presentada el pasado 12 de septiembre en el Foro para el conocimiento y conservación de los Oyametales del Occidente de México. La ponencia presenta una parte de los resultados incluidos en nuestro nuevo articulo sobre Abies jaliscana, que esta por salir.

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Jul 31, 2014

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Just received Statemento of Accomplishment for Bioinformatics course in Johns Hopkins University, though it was done several weeks ago.
http://vshalisko.blogspot.com/2014/07/just-received-statemento-of.html Читать дальше......

Jul 30, 2014

Just received Statement of Accomplishment for Bioinformatics course in Johns Hopkins University, though it was done several weeks ago.

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Jun 6, 2014

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Россия счастие. Россия свет. А может быть, России вовсе нет. Россия тишина. Россия прах. А может быть, Россия — только страх. ( Георгий Иванов , 1931) О лишних людях и новой волне эмиграции, которой социологически даже будто бы и нет. Colta.ru Андрей Лошак.... Читать дальше......

May 23, 2014

Fabulous posters by T.

Fabulous posters by T. Cole & H. Hilger on Land Plants Phylogeny. One poster for Bryophytes, another on Tracheophytes and third on Angiosperms. Rather useful for teaching.

http://www.bcp.fu-berlin.de/biologie/arbeitsgruppen/botanik/ag_hilger/publikationen/index.html
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May 22, 2014

It´s a bit of true, bu not all the true about "narrative".


It´s a bit of true, bu not all the true about "narrative". Читать дальше......

May 21, 2014

Ponencia en el seminario de botánica

Ponencia en el seminario de botánica
Hoy presente mi ponencia en el seminario: Biogeografía de los helechos arborescentes de la familia Cyatheaceae . Resumen en PDF Ponencia en PDF Resumen La familia Cyatheaceae es un grupo monofilético de pteridofitas, soportado por datos morfológicos y molec...
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Ponencia en el seminario de botánica

Hoy presente mi ponencia en el seminario: Biogeografía de los helechos arborescentes de la familia Cyatheaceae.

Resumen en PDF Ponencia en PDF

Resumen

La familia Cyatheaceae es un grupo monofilético de pteridofitas, soportado por datos morfológicos y moleculares. Su distribución incluye trópicos y subtropicos de ambos hemisferios, donde estas plantas habitan en los bosques húmedos de montaña; algunos representantes penetran a las montañas templadas de Nueva Zelanda, América del Sur, India, China y Japón. En la estructura filogenética de los Cyatheaceae modernos se reconocen cuatro principales clados: Alsophila, Cyathea, Gymnosphaera y Sphaeropteris. En el registro fósil Cyatheaceae aparece por primera vez en el Jurasico Superior de Tasmania, varias especies fueron descritas de los sedimentos del Cretácico Inferior del hemisferio norte.

El trabajo de Korall y Pryer (2014) sobre biogeografía histórica de Cyatheaceae incluye análisis de eventos de dispersión y vicarianza en la evolución del grupo en escala global, inferido con los métodos de biogeografía filogenética. La inferencia filogenética, la estimación de fechas de divergencia entre los linajes y el análisis biogeográfico se basan en las secuencias de las cinco regiones del genoma de cloroplastos, obtenidas para 78 taxa. Los autores estiman una posible fecha de divergencia entre Cyatheaceae y su grupo hermano Dicksoniaceae en 150 Ma; el grupo corona que incluye todas las especies modernas se formo en mediados del Cretacico (96 Ma). El análisis revela un complejo escenario de eventos vicariantes en el territorio derivado de Gondwana, combinado con una serie de dispersiones transoceánicas y la secuencia de eventos de expansión de rangos de distribución. El territorio de distribución inicial de Cyatheaceae inferido es Australia y/o América del Sur.

A pesar de que las unidades de dispersión de los helechos son las diminutas esporas transportadas por el viento con facilidad, las peculiaridades de su compleja biología reproductiva (fenómeno conocido como "outcrossing") reducen la frecuencia de eventos de colonización exitosa de nuevos territorios. En el caso de Cyatheaceae fueron identificados por lo menos nueve eventos de dispersión transoceánica en el transcurso de la evolución del grupo, requeridos para explicar su distribución observada. Evaluando el número de eventos de dispersión por linaje y por tiempo, los autores consideran que es significativamente mas baja que en otros clados de helechos.

El trabajo de Korall y Pryer (2014) es la continuación de la investigación de Korall et al. (2007) sobre filogenia de Cyatheaceae. Sus resultados se contrastan con los datos de Janssen et al. (2008) y Schneider et al. (2010) en la explicación de una posible área ancestral de Alsophila y la secuencia de colonización de Madagascar por los linajes de helechos arborescentes, entre otras peculiaridades.

Bibliografía:

  • Korall, P. y K.M. Pryer. 2014. Global biogeography of scaly tree ferns (Cyatheaceae): evidence for Gondwanan vicariance and limited transoceanic dispersal. Journal of Biogeography 41: 402–413.
  • Korall, P., D.S. Conant, J.S. Metzgar, H. Schneider y K.M. Pryer. 2007. A molecular phylogeny of scaly tree ferns (Cyatheaceae). American Journal of Botany 94: 873–886.
  • Janssen, T., N. Bystriakova, F. Rakotondrainibe, D. Coomes, J.N. Labat y H. Schneider. 2008. Neoendemism in Madagascan scaly tree ferns results from recent, coincident diversification bursts. Evolution 62: 1876–1889.
  • Schneider, H., T. Janssen, N. Byrstiakova, J. Heinrichs, S. Hennequin y F. Rakotondrainibe. 2010. Rapid radiations and neoendemism in the Madagascan biodiversity hotspot. En M. Glaubrecht (ed.). Evolution in Action. Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg. Pp. 3-15.

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  • May 14, 2014

    Apr 15, 2014

    New York City skyline from Empire State

    New York City skyline from Empire State







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    Visita al herbario NY. Para revisar coleccion de helechos epifitos. Encantado con todo.

    Visita al herbario NY. Para revisar coleccion de helechos epifitos. Encantado con todo.


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    Apr 10, 2014

    Hoy mis alumnos han estudiado familia Poaceae.

    Hoy mis alumnos han estudiado familia Poaceae.
    Entre los hechizos que vimos fueron:
    Panicum maximum - este hechizo causa temor y pánico extremos, sobre todo es útil durante un examen;
    Bromus gracilis - aplicación de este conjuro produce en victima deseo de bromear y decir cosas graciosas sin parar. Читать дальше......

    Apr 8, 2014

    Statistical Learning completed

    I had successfully completed the on-line course Statistical Learning imparted by T. Hastie & R. Tibshirani in Stanford University. Читать дальше......

    Mar 20, 2014

    А. С. Пушкин. 1823.

    А. С. Пушкин. 1823.

    Свободы сеятель пустынный,
    Я вышел рано, до звезды;
    Рукою чистой и безвинной
    В порабощенные бразды
    Бросал живительное семя —
    Но потерял я только время,
    Благие мысли и труды...

    Паситесь, мирные народы!
    Вас не разбудит чести клич.
    К чему стадам дары свободы?
    Их должно резать или стричь.
    Наследство их из рода в роды
    Ярмо с гремушками да бич Читать дальше......

    Mar 1, 2014

    Hoy fuimos a ver El Príncipe Igor, transmitida de Opera Metropolitana de Nueva York. La interpretación en MET...

    Hoy fuimos a ver El Príncipe Igor, transmitida de Opera Metropolitana de Nueva York. La interpretación en MET comienza con la frase "To unleash a war is the surest way to escape from oneself" - algo completamente vigente hoy el día.

    Es una ópera espectacular, con la música enormemente bella y compleja de Alexander Borodin, y con una reinterpretación moderna de escenografía, diseñada por Dmitri Tcherniakov. Opera es la interpretación musical de los eventos historicos que han tenido lugar en la historia del estado ruso en el siglo XI y descritas en El cantar del príncipe Igor. Esta obra tiene una vigencia impresionante en el contexto de las actuales problemas políticas en la Europa del Este, particularmente en Ucrania y Rusia - mismos territorios donde se desarrolla la historia original. Las problemas políticas, históricas y éticas mencionadas en la opera parecen persistir en las acciones de los gobernantes de Rusia desde los tiempos de Igor. Parece que no ha cambiado nada en estos 10 siglos. 

    (http://www.nybooks.com/articles/archives/2014/mar/20/great-prince-igor/?pagination=false)

    (http://www.metoperafamily.org/uploadedFiles/MetOpera/8_live_in_hd/cast%20sheets/Igor.synopsis.US.pdf)
    http://www.nybooks.com/articles/archives/2014/mar/20/great-prince-igor/?pagination=false Читать дальше......

    Jan 10, 2014

    El barco legendario visita Puerto Vallarta del 11 a 13 de enero.

    El barco legendario visita Puerto Vallarta del 11 a 13 de enero. (http://www.subetealbarco.org/rainbow/?origen=mailCibersRW10012014&hq_e=el&hq_m=2970082&hq_l=3&hq_v=fec20b1bd5
    ¡Lastima que por el trabajo de campo en Chiapas no voy a podes subir a Rainbow Warrior de Greenpeace esta vez!
    http://www.subetealbarco.org/rainbow/?origen=mailCibersRW10012014&hq_e=el&hq_m=2970082&hq_l=3&hq_v=fec20b1bd5 Читать дальше......

    Jan 5, 2014

    El que a este mundo Vino y no bebió Vino ¡A que coño Vino!

    El que a este mundo Vino y no bebió Vino ¡A que coño Vino!

    La comida, bebida y ambiente en La Viña de Bacco (San Cristobal de las Casas) con excelentes y exquisitos.
    Tome lo mismo que consumio Matt Gross de NY Times hace 5 años, y con el mismo costo.
    Es mi segunda visita a este lugar (bar). Lo considero muy recomendable.

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